Микроскоп обеспечивает работу в режимах высокоразрешающей просвечивающей электронной микроскопии (ВРЭМ), сканирующей просвечивающей микроскопии (СПМ), получение дифракционных картин, включая дифракцию в сходящихся пучках, проведение спектрального анализа и картирования с помощью EDS и EELS. Основные измеряемые характеристики: морфология, структура, химический состав.

Проведение литографии остросфокусированным пучком электронов, получение растровых электронно-микроскопических изображений.